Bij Zulte Waregem verwachtte men veel van Jens Naessens, maar na een goede start werd het minder. Hij trok via KV Mechelen naar KVC Westerlo. Naessens kon in zijn goede periode bij Essevee naar de Belgische top.
"Als speler van Zulte Waregem had ik ook naar Club Brugge of AA Gent kunnen gaan. Club Brugge bereikte echter geen akkoord met Zulte Waregem en de transfer naar Gent werd afgeblazen door een knieblessure", zei hij aan Gazet van Antwerpen.
Toch denkt hij er niet al te vaak meer aan terug. “Ik was een speler die in de belangstelling van de topclubs stond en plots zit je in een dip. Dan hoor je weleens dat ik boven mijn niveau had gepresteerd. Soms denk je: Wat als…? Maar als Club Brugge Champions League speelt, zit ik daar niet mee in mijn hoofd. Ik heb dat een plaats kunnen geven."